哈尔滨工业大学团队合作在Nature Communications再发文章

　　2024年8月18日，哈尔滨工业大学蒋庆华，哈尔滨医科大学季勇、许召春共同通讯在Nature Communications 在线发表题为“Deciphering cell–cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network”的研究论文，该研究提出了一种名为DeepTalk的通用方法，通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和空间转录组学(ST)数据，以单细胞分辨率推断空间CCC。

　　细胞间通讯(CCC)的推断对于更好地理解生物系统中复杂的细胞动力学和调节机制至关重要。然而，在单细胞分辨率下准确推断空间CCCs仍然是一个重大挑战。DeepTalk利用图关注网络(GAT)集成scRNA-seq和ST数据，从而能够对单细胞ST数据进行准确的细胞类型识别，并对基于点的ST数据进行反卷积。然后，DeepTalk可以利用基于子图的GAT捕获多层次细胞之间的连接，进一步实现单细胞分辨率的空间分辨CCC推理。DeepTalk在多个跨平台数据集上发现有意义的空间CCCs方面取得了优异的成绩，这证明了其在复杂生物过程中剖析细胞行为的卓越能力。

　　Nature子刊阵容壮大，而在璀璨的星空中，Nature Communications(NC)以其独特的身份脱颖而出。作为Nature打头的综合性期刊，NC虽同属子刊序列，却展现出别样的风采。以其广泛的接受领域、庞大的发文量，以及对高质量研究的开放态度，成为了众多科研工作者展示成果的重要平台。

　　Nature子刊，即Nature Research Journals，是科研细分领域的璀璨星辰，每一本都专注于某一特定研究方向，以深度与广度并重的内容，成为各自领域内不可或缺的权威之声。这些子刊不仅数量众多，且质量上乘，多数拥有较高的影响因子，代表着所在领域的科研前沿与顶尖水平。

　　Nature旗下期刊(共200种)，根据学术界的认可度与影响力，可大致划分为5大类别：

　　01正刊：作为Nature系列期刊的领头羊，《Nature》正刊以其无与伦比的权威性和影响力，稳居科研殿堂的顶端。

　　02Nature打头的研究系列子刊与Review系列子刊：这两大系列共计69本子刊，覆盖了生命科学、物理科学、临床医学和社会科学等多个领域，以深度分析和前沿研究著称，是各自领域的权威期刊。

　　03Nature Communications(NC)：作为Nature打头的特殊子刊，NC以其综合性、开放性和庞大的发文量，成为连接科研人员与科研成果的重要桥梁。

　　04Nature 合作创办的刊物：Nature出版集团与其他单位携手合作，推出了128种高质量期刊，这些刊物在学术水平上不亚于子刊，为科研人员提供了更多元化的发表选择。

　　05Scientific Reports：作为Nature Portfolio旗下的一本多学科开放获取期刊，Scientific Reports以其广泛的接受领域和快速的同行评审流程，为科研人员提供了一个展示初步研究成果的优质平台。尽管有时被部分学者视为“水刊”，但其开放性和高效性无疑为科研界带来了更多的活力和多样性。

　　无论是以第一作者，通讯作者，还是第一单位在nature期刊发表论文，都可以带来极大的荣誉，而且Nature始终以其卓越的品质和广泛的影响力，引领着全球科研的潮流与方向。

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